Durante o século XVIII, grupos jesuítas assumiram a tarefa de evangelizar a região conhecida como Grande ABCD, especialmente os índios que habitavam o local. Por meio de suas ações, eles conseguiram adquirir vastas áreas de terra, e o padre Salvador Pires Santiago construiu uma capela em homenagem a Nossa Senhora da Conceição. Localizada na região central de Diadema, a capela se manteve ativa até meados do século XIX. No entanto, com a independência do Brasil, o trabalho dos jesuítas foi encerrado, e a capela acabou caindo em ruínas.
Foi somente na década de 1920 que as ruínas da antiga capela dos jesuítas foram descobertas pelo pesquisador José Batista de Campos Aguirra, membro do Instituto Histórico e Geográfico de São Paulo, que comunicou o fato à instituição. Diante da ausência de um centro religioso no loteamento da Vila Conceição, as ruínas se tornaram um modesto centro religioso em 1927, principalmente porque ainda abrigavam a imagem da padroeira.
A falta de um centro religioso adequado levou os moradores locais, na década de 1930, a discutirem a possibilidade de construir uma nova capela em honra a Nossa Senhora da Conceição. O terreno escolhido para essa construção ficava em frente à Rua Manoel da Nóbrega e foi oficialmente doado, em 19/11/1940, pela Empresa Urbanística da Vila Conceição para a Mitra Arquidiocesana de São Paulo. Após meses de intenso trabalho, a capela foi finalmente inaugurada em fevereiro de 1941.
Durante a década de 1940, a capela, futura matriz, esteve sob a assistência dos padres da Paróquia São Judas Tadeu, do Jabaquara, pois a Matriz de São Bernardo se encontrava a uma grande distância, e a estrada que ligava a Vila Conceição a São Bernardo estava em condições precárias. Em 12/06/1949, durante uma visita à região do ABCD, o cardeal Arcebispo de São Paulo, Dom Carlos Carmelo de Vasconcelos Motta, conheceu a capela Imaculada. Após forte insistência dos moradores e fiéis da região, a capela foi elevada à categoria de Paróquia.
Essa elevação ocorreu somente quatro anos depois, enquanto a casa paroquial foi construída com o auxílio de uma comissão liderada por Evandro Caiaffa Esquivel, futuro primeiro prefeito de Diadema. Em maio de 1950, um festival foi organizado com o intuito de angariar fundos para a obra, em um terreno doado por Arthur Sampaio Moreira. A solenidade de elevação ocorreu em 29 de junho de 1953, festa de São Pedro e São Paulo Apóstolo, conduzida pelo cardeal Motta.
Em 16/05/54, durante o Ano Jubilar em Ação de Graças pelo centenário do dogma da Imaculada Conceição proclamado pelo Papa Pio XII, o cardeal deu posse ao primeiro pároco, Padre Arnaldo. Ele celebrou a primeira missa pela manhã e realizou a bênção do santíssimo à tarde no mesmo dia.
Em 18 de julho de 1954, o papa Pio XII oficialmente criou a Diocese de Santo André, tendo como primeiro bispo Dom Jorge Marcos de Oliveira. A região do ABCD foi desmembrada da Arquidiocese de São Paulo. Os padres que atuavam na região tiveram a opção de permanecer na Arquidiocese ou transferir-se para a nova diocese. Padre Arnaldo escolheu permanecer na Arquidiocese de São Paulo e, consequentemente, afastou-se da Paróquia Imaculada Conceição por volta de 13 de setembro de 1954.
Após a saída do Padre Arnaldo, a paróquia passou vários meses sem um pároco, até que o padre Carlos Piasentiny foi nomeado em 15/04/1955. No entanto, não houve uma cerimônia oficial de posse, e, por esse motivo, não há registros documentais do Padre Carlos. De acordo com depoimentos posteriores, ele emocionou-se profundamente ao celebrar sua primeira missa na paróquia, que contou com a participação de poucas pessoas.
Ao longo dos últimos 70 anos, vários presbíteros se uniram ao povo da matriz para dedicar-se à evangelização:
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Padre Agostinho Bertoli: de 10/12/1956 a 20/3/1973
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Padre José Aguirre Suberviola: de 25/3/1973 a 31/12/1976
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Dom Manuel Parrado Carral: de 1/1/1977 a 23/2/1986
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Padre Paulo Bezerra de Carvalho: de 2/3/1986 a 16/2/1992
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Padre José Ailton Teixeira: de 16/2/1992 a 8/3/1998
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Padre Wagner Doriguetti: de 8/3/1998 a 4/9/2004
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Padre Antônio Guimarães do Couto Filho: de 5/9/2004 a 24/4/2011
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Padre Guillermo Daniel Micheletti: de 19/6/2011 a 17/2/2013
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Padre Ademir Santos de Oliveira: de 17/2/2013 a 5/11/2015
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Padre José Pedro Teixeira de Jesus: de 5/11/2015 a 9/2/2019
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Padre Dayvid da Silva: desde 9/2/2019 até o presente.
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